生命系学生のゲノム解析覚え書き

大抵インフォ、時々バイオ、稀にアグリな日記

2022-01-01から1年間の記事一覧

samtoolsの使い方色々

samtoolsの使い方をまとめます #インストール 基本的にはcondaを使ってインストールするのが良いです。 condaはOSを考えなくていいし、何よりウェブサイトに飛ばなくてもいいうえにコンパイルしなくて良い。 コンパイル時に必要なツールがイモ蔓式に出てきて…

RNA-seqアセンブリについて

年度初めということでまた書き始めようと思います。いつまで続くのでしょうか。 さて、これまでひたすらゲノムが読まれていないニッチな生物でRNA-seq解析を行っていました。 流れとしては図の通り。多分ゲノムが読まれていない生物でのRNA-seq解析で一番困…