Linux環境はじめました
さすがに入れなきゃなあということでubuntu使ってLinux環境にしました。早速samtools入れようと思ったが、unable to locate packageてでてきて、apt アップデートすればいんじゃねと思ったら次はaptのアップデートもファイルがロックされてますやらなんとやらでできず。。。
調べたらとりあえず再起動してみ、とのことだったのでubuntu再起動してリトライ。aptのアップデートはできた、が、相変わらずsamtoolsのアップデートできず。そういやapt-getのアップデートはしてなかったなと(aptの中にapt-get入ってるぽい?)と思いこのアップデートしたらドンピシャ。無事samtools入りましたとさ。
またubuntuの実行ディレクトリが不明だったが、これもファイル欄にwsl$と検索すると発見できたのですかさずデスクトップにリンクコピー。先生にbioinfoのファイル作ってもらったのでこんどからはデータ全部そこに入れよう。これでLinuxの環境構築は一通り終わりかな。いやはや、こういうの、環境構築でひと悶着かならずあるよねええ。。。
RNAseqのもとデータはもらったから後はpythonとBashを極める()だけ。極めるつてもようやくクラスの作り方とか、もやもやしてたものを解決できたレベル。これ自分でコードかける日は来るのか。。。明日は例の論文にも目を通さんと。