生命系学生のゲノム解析覚え書き

大抵インフォ、時々バイオ、稀にアグリな日記

2020-12-20から1日間の記事一覧

BioPythonまとめ その2

その1が長くなったのでその2です。 ~NGS処理ツール~ まずはおなじみSAM・BAMファイルからの抽出をpythonでもやってしまおうというもの。できるんですね。Linuxでやると調べるのに苦労するからpythonで実装してくれていてとてもありがたい。ちなみにこいつ…

getattr使い方

もう完全にpythonのことしか書いてない・・・(笑) getattrで苦戦したので書き残しておく。 問題のコードは下。recordはオブジェクト。 for u in dir (record): if u[0] != '__' : print(u,getattr(record,u)) これが意味わからんかった。record内の属性をd…